组织功勋是火影忍者手游中重要的资源，直接影响玩家在组织内的地位和声望。通过每日祈福、参与组织活动、提升战力等方式可以稳定获取功勋。每日祈福是最基础的功勋来源，VIP等级越高可祈福次数越多，建议玩家每日完成所有祈福次数。焚香祈福和纳贡祈福提供的功勋数量不同，玩家可根据自身资源选择适合的祈福方式。
迎击叛忍是获取大量功勋的重要途径，该活动由组织首领或高层开启，分为上、中、下及叛忍头目四种难度。不同级别叛忍奖励的功勋数量各异，建议玩家根据自身战力选择合适的难度参与。活动结束后还可领取额外功勋宝箱，通常包含1000以上功勋。参与组织活动需注意时间安排，确保不错过开启时段。
小队突袭提供助战获取功勋的机制，每日前三次助战分别可获得100、200、300功勋，总计600功勋。建议玩家积极回应组织成员的助战邀请，既能获取功勋也能增进组织协作。要塞争夺战作为周常活动，参与战斗并取得胜利的组织成员将获得丰厚功勋奖励，战力提升直接影响在该活动中的贡献度。
提升个人战力是长期稳定获取更多功勋的基础。通过培养忍者、升级装备、强化秘卷等方式提高战力，能在组织活动中表现更出色，从而获得更高功勋奖励。参与组织任务和限时活动也是功勋的重要补充来源，这些活动通常要求完成特定条件，奖励包含大量功勋。建议玩家密切关注组织公告，及时参与各类活动。
组织商店兑换策略影响功勋使用效率。优先兑换忍者碎片等稀缺资源，避免功勋闲置。加入活跃组织至关重要，活跃组织能稳定开启叛忍等活动，提供更多获取功勋的机会。功勋获取需要长期坚持和规划，合理分配游戏时间参与各类活动，才能最大化功勋收益。
